26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0114 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0114  PaREP1 domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  330  6e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1160  PaREP1 domain-containing protein  64 
 
 
157 aa  202  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.612279  hitchhiker  0.00829062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0294  PaREP1 protein  58.44 
 
 
160 aa  198  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0965823  normal  0.0513269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0097  PaREP8 domain-containing protein  61.07 
 
 
155 aa  192  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0565  PaREP1 domain-containing protein  60.4 
 
 
156 aa  185  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1916  PaREP1 family protein  62.59 
 
 
155 aa  184  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.445823 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0290  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  59.42 
 
 
155 aa  160  7e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0289  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  57.14 
 
 
136 aa  143  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1582  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  51.47 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1182  PaREP1 domain-containing protein  53.39 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.289921  normal  0.0477307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2043  paREP8  56.18 
 
 
99 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0279  PaREP1 family protein  42.86 
 
 
185 aa  100  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1379  PaREP8 domain-containing protein  42.4 
 
 
152 aa  99  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.611746  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0878  PaREP1 domain-containing protein  71.21 
 
 
100 aa  98.2  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.927069  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0049  PaREP1/PaREP8 domain-contain protein  34.87 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2188  PaREP1 domain-containing protein  44.55 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.881035  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1309  PaREP8 domain-containing protein  37.75 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00105694  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0526  PaREP1 domain-containing protein  26.52 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0265623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1501  PaREP8 domain-containing protein  34.72 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0237073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1414  PaREP8 domain-containing protein  31.45 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.199569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0531  PaREP1 protein  31.01 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.372762  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0972  PaREP8 domain-containing protein  51.92 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296488  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0388  PaREP1 protein  38.67 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0430503  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0091  PaREP8 domain-containing protein  26.39 
 
 
169 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1935  PaREP8 domain-containing protein  38.57 
 
 
167 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000928236 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1023  PaREP1 family protein  27.43 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0120511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>