More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0881 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
240 aa  471  1e-132  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0782  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  75.97 
 
 
233 aa  367  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00638916  normal  0.0859094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2117  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  74.15 
 
 
247 aa  351  7e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1767  pyrroline-5-carboxylate reductase  75.13 
 
 
193 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  34 
 
 
271 aa  118  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.75 
 
 
274 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.75 
 
 
284 aa  92.8  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 
272 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.07 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.12 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.13 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.34 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.7 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.5 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.03 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.29 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.89 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.2 
 
 
267 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.75 
 
 
265 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.4 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  23.77 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.22 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.8 
 
 
281 aa  68.6  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.48 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.55 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.1 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  30.77 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  28.88 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.28 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.14 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.7 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.71 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.53 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.43 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.69 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.77 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.09 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.41 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.38 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.67 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.09 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3016  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.78 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.63 
 
 
264 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.92 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2207  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.95 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.92 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.5 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.23 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
280 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.34 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.2 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.55 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
272 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  27.75 
 
 
278 aa  62.4  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.33 
 
 
263 aa  62  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.1 
 
 
275 aa  62  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
279 aa  62  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.86 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0842  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.81 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.51 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.06 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.65 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.42 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.62 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
274 aa  60.1  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.35 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.6 
 
 
282 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.47 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.99 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.03 
 
 
275 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.05 
 
 
281 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.48 
 
 
264 aa  58.9  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.35 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.83 
 
 
282 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.05 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
264 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.19 
 
 
269 aa  58.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.02 
 
 
277 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.09 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.18 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.7 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>