More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0977 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
271 aa  538  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.33 
 
 
274 aa  291  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.29 
 
 
284 aa  271  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
270 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
257 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.71 
 
 
272 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.2 
 
 
271 aa  142  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.16 
 
 
271 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
264 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
280 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
260 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.5 
 
 
269 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.08 
 
 
262 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
274 aa  136  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.56 
 
 
260 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  35 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  35.52 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.47 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
280 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.7 
 
 
272 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.15 
 
 
279 aa  131  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.78 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.44 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.15 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.8 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.61 
 
 
278 aa  130  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2833  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.07 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.97 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
270 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.15 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.5 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.31 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.31 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.06 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.31 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.1 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3883  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.04 
 
 
279 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
272 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.23 
 
 
271 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
276 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.24 
 
 
255 aa  126  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.68 
 
 
279 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
280 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.26 
 
 
270 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
255 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2117  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.48 
 
 
247 aa  123  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
274 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0782  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.63 
 
 
233 aa  123  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00638916  normal  0.0859094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.17 
 
 
260 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
274 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
285 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
274 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.81 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.98 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.39 
 
 
267 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
281 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.86 
 
 
272 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
274 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
266 aa  119  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  27.84 
 
 
289 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
271 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04471  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.36 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.28 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.8 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.86 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.4 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.84 
 
 
271 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  34.76 
 
 
276 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.28 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.47 
 
 
272 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.27 
 
 
240 aa  115  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.27 
 
 
272 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4204  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
272 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00182559  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.02 
 
 
268 aa  115  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.1 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.09 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.32 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.04 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.42 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.56 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.38 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>