More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35750 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
277 aa  555  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  36.94 
 
 
313 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
274 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.28 
 
 
282 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
262 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
280 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.71 
 
 
274 aa  148  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.07 
 
 
270 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.56 
 
 
271 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
272 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
272 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.16 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
266 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.7 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.18 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
263 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
272 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.64 
 
 
264 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
272 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
264 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.75 
 
 
269 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
271 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.83 
 
 
264 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.8 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.63 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.25 
 
 
270 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.03 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.21 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.44 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  35.36 
 
 
289 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.26 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.59 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.16 
 
 
265 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.04 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
276 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
276 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.78 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.68 
 
 
255 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.25 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.78 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.32 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.2 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
267 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.98 
 
 
272 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.73 
 
 
267 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.48 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
264 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  37.95 
 
 
276 aa  125  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.75 
 
 
274 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.42 
 
 
270 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
255 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.57 
 
 
270 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.77 
 
 
281 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.65 
 
 
270 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.75 
 
 
274 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.27 
 
 
274 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0893  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.07 
 
 
276 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.585306  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.37 
 
 
272 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
264 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 
270 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  33.72 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.07 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.39 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
269 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.02 
 
 
272 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.85 
 
 
272 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
270 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.47 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.24 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06025  hypothetical pyrroline-5-carboxylate reductase (Eurofung)  33.1 
 
 
299 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.142925 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.91 
 
 
270 aa  118  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.42 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  33.64 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.4 
 
 
266 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>