More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0358 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  95.69 
 
 
255 aa  484  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
268 aa  158  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
260 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
262 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
271 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
265 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
266 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.82 
 
 
264 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.82 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.1 
 
 
274 aa  142  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.9 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.91 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.68 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
271 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
272 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12663  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.2 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549877  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
267 aa  136  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
276 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
281 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
263 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.46 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.15 
 
 
272 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.69 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  33.82 
 
 
289 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.27 
 
 
279 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.25 
 
 
269 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.28 
 
 
280 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
273 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
276 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 
282 aa  131  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2273  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.45 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.642771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.39 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.82 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.2 
 
 
272 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.63 
 
 
267 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.62 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.08 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.68 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.22 
 
 
267 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.45 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
282 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
270 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.42 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.44 
 
 
264 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.81 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.1 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.68 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.37 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.69 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.86 
 
 
266 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
272 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
271 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
274 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.24 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  37.06 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.36 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  37.75 
 
 
275 aa  125  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
274 aa  125  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
272 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.57 
 
 
272 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
270 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.83 
 
 
272 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0937  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
268 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 
280 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
276 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.45 
 
 
272 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.27 
 
 
270 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
276 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
276 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.66 
 
 
272 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
267 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.19 
 
 
270 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
270 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
271 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.23 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.27 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>