More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1731 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
266 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  96.62 
 
 
280 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  61.22 
 
 
276 aa  334  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  60.46 
 
 
280 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  57.41 
 
 
275 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.27 
 
 
270 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04581  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  46.56 
 
 
270 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.958879  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.73 
 
 
270 aa  238  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04161  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
270 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04471  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 
270 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.42 
 
 
270 aa  202  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.32 
 
 
269 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 
271 aa  187  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
257 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.53 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
264 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 
275 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
274 aa  169  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
266 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.5 
 
 
264 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  41.38 
 
 
289 aa  149  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.59 
 
 
272 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.39 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
262 aa  146  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.57 
 
 
271 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
281 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.84 
 
 
279 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.14 
 
 
270 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.2 
 
 
265 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.04 
 
 
279 aa  143  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
272 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.23 
 
 
264 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.02 
 
 
260 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.54 
 
 
270 aa  141  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.33 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  34.34 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.34 
 
 
269 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.27 
 
 
272 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.61 
 
 
276 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
272 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.72 
 
 
272 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
280 aa  139  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
269 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
270 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.3 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.74 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.57 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.86 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
271 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.82 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  36.05 
 
 
313 aa  135  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.68 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.7 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
267 aa  131  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.61 
 
 
263 aa  131  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.06 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.21 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
274 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
273 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
272 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.57 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.38 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  29 
 
 
289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.41 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  35.78 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.2 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.98 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.51 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
284 aa  127  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3315  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.44 
 
 
545 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112509  normal  0.0752896 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.86 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.94 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.95 
 
 
263 aa  125  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>