More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_04161 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_04161  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
270 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04471  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  94.07 
 
 
270 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  86.62 
 
 
270 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04581  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  74.44 
 
 
270 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.958879  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  43.59 
 
 
280 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  43.43 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.78 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
276 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 
266 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
275 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
271 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
272 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 
269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.97 
 
 
257 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
264 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.07 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.81 
 
 
274 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.5 
 
 
272 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.31 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
266 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.93 
 
 
271 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 
264 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.59 
 
 
260 aa  141  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.2 
 
 
264 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.26 
 
 
271 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
270 aa  135  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.97 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.09 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.09 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.09 
 
 
267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.77 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
276 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.31 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.61 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.09 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.52 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.72 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.57 
 
 
267 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.7 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.7 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.98 
 
 
272 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.09 
 
 
274 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
267 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.3 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.04 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 
272 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
270 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.41 
 
 
276 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.48 
 
 
270 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.04 
 
 
269 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.85 
 
 
270 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.41 
 
 
274 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.37 
 
 
272 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.45 
 
 
268 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 
272 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 
272 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.17 
 
 
264 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
272 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
279 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.31 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  27.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.57 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.87 
 
 
263 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  27.44 
 
 
289 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.49 
 
 
265 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.61 
 
 
270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.97 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.3 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.41 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  28.78 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  30.88 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.94 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.31 
 
 
269 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
255 aa  118  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.31 
 
 
272 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.6 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.68 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>