More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1839 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.64 
 
 
274 aa  315  4e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.29 
 
 
271 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.7 
 
 
274 aa  155  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.15 
 
 
262 aa  152  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
264 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.35 
 
 
257 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  34.28 
 
 
289 aa  145  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
264 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.4 
 
 
272 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.66 
 
 
260 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.23 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.91 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.99 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.67 
 
 
271 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0649  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  36.9 
 
 
275 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.94 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 
280 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.12 
 
 
274 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.85 
 
 
275 aa  136  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.74 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
269 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
273 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.84 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1723  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.97 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000160405  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21461  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.04 
 
 
271 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.02 
 
 
278 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
270 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
267 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.3 
 
 
281 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.06 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04481  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  31.21 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.58 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.82 
 
 
272 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24470  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.33 
 
 
279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.14 
 
 
272 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.21 
 
 
270 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  34.98 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.3 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.72 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.17 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.46 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1731  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.21 
 
 
266 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2023  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
270 aa  126  5e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.720475  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
279 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
272 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
279 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.4 
 
 
281 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
274 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.62 
 
 
265 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.73 
 
 
260 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 
270 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.16 
 
 
266 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.78 
 
 
267 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.47 
 
 
270 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.15 
 
 
270 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.68 
 
 
252 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
274 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.76 
 
 
266 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
272 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.27 
 
 
274 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.12 
 
 
282 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3969  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.36 
 
 
279 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.65 
 
 
272 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.29 
 
 
260 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03931  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  32.6 
 
 
276 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.08 
 
 
270 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4045  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.29 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3891  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.71 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4359  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.29 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0860  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.09 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.012848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4246  pyrroline-5-carboxylate reductase  30 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4160  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.29 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.2 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.78 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.53 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.72 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.9 
 
 
272 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.92 
 
 
265 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0990  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.64 
 
 
279 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.91 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>