More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0782 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0782  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
233 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00638916  normal  0.0859094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2117  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  75.97 
 
 
247 aa  358  3e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1767  pyrroline-5-carboxylate reductase  91.67 
 
 
193 aa  357  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  75.97 
 
 
240 aa  354  5e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0977  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.63 
 
 
271 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0669061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1475  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.43 
 
 
274 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.6 
 
 
284 aa  93.6  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.03 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1304  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.68 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0974  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.62 
 
 
278 aa  86.3  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.917408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0780  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.15 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.22 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.07 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.64 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0358  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.64 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.07 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.68 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0926  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.5 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.75 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.88 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.88 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.96 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.94 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.34 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1828  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.34 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.217574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.06 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35750  delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.64 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0173  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.07 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0563052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.83 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.17 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1339  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.18 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000013369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.51 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.83 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.08 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0841  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.83 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.03 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1345  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282984  normal  0.101206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.67 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.57 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.69 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2207  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.78 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.21 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  28.93 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  26.96 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.35 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.88 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04581  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  29.36 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.958879  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.09 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.43 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0568  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.26 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000161588  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04161  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  26.25 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  28 
 
 
281 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0392  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.23 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.72 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.81 
 
 
276 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1809  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.81 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.921292  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.76 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.1 
 
 
267 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0791  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
252 aa  63.2  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.03 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.27 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.13 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.8 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.1 
 
 
275 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.24 
 
 
273 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.49 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2080  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.22 
 
 
263 aa  62  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  27.1 
 
 
267 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.13 
 
 
274 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.69 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2581  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.23 
 
 
272 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0897618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.43 
 
 
272 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2889  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.02 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.792584  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.25 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0351  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.37 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.42 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04471  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  28.79 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.94 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8353  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.47 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.21 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.21 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.93 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.49 
 
 
272 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  26.69 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.77 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4270  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  28.57 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0842  pyrroline-5-carboxylate reductase  25.53 
 
 
258 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.1 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1373  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.1 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.2219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4207  pyrroline-5-carboxylate reductase  24.53 
 
 
279 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>