64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4087 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4087  redoxin  100 
 
 		 193 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.39 
 
 		 178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  51.43 
 
 		 178 aa  201  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  49.13 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  50 
 
 		 179 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.76 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  48.3 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  32.39 
 
 		 168 aa  104  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  31.64 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  32.78 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.95 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.55 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  31.21 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  24.43 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  26.67 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.86 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  27.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  27.78 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  23.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  23.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  25.93 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  26.92 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.01 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.54 
 
 		 282 aa  48.5  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0849988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  29.46 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.36 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0912  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.38 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.456299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1128  redoxin  21.77 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.138715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  25.48 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.35 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12542  bacterioferritin comigratory protein bcp  26.61 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000415543  hitchhiker  0.00456556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  20.32 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.37 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.37 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.37 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.03 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.37 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2815  redoxin domain-containing protein  26.72 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  29.36 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3657  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.517084  normal  0.0138623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1322  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.11 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5164  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.85 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3717  redoxin domain-containing protein  26.17 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.050319  normal  0.718647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3644  redoxin  26.17 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  23.12 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0090  peptidase C60, sortase A and B  23.44 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  23.12 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.22 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.45 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5635  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.42 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  22.06 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  27.52 
 
 		 226 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.82 
 
 		 658 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  25.93 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1159  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.96 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0675294  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0274  redoxin  20.86 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.15 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2535  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.46 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0560  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.81 
 
 		 154 aa  41.6  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.26632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  23.74 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>