53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03139 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  100 
 
 		 178 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.32 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  55.56 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  53.49 
 
 		 179 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.86 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  51.43 
 
 		 193 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  49.71 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.68 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  34.86 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.61 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  32.04 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  30.73 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.11 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  30.64 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.77 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  24.72 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.97 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2810  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  25 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000162826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0352  redoxin  24.29 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.84 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.94 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0958  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  24.83 
 
 		 189 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4120  redoxin domain-containing protein  26.24 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585528  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.85 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3638  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.45 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2683  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.68 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.399218  normal  0.169075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3444  peroxiredoxin  23.45 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1066  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.84 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0801  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.14 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0183  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.14 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.144307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3222  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.14 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3325  alkyl hydroperoxide reductase/Thiol specific antioxidant/Mal allergen  24.14 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0849  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.51 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3517  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.45 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0896  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.83 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.14 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4717  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  23.31 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.25 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3717  redoxin domain-containing protein  30.19 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.050319  normal  0.718647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3657  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.517084  normal  0.0138623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3644  redoxin  30.19 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.59 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1128  redoxin  23.31 
 
 		 152 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.138715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0792  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.22 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.124423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0617  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  23.45 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0928  peroxiredoxin  23.7 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4880  peroxiredoxin  21.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1511  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.83 
 
 		 161 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1413  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.77 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0354394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  20.83 
 
 		 211 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0912  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.46 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.456299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  20.69 
 
 		 215 aa  40.8  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5635  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.46 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>