60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6336 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.47 
 
 		 178 aa  244  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  65.9 
 
 		 178 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  63.95 
 
 		 182 aa  231  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  61.05 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  44.12 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.35 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.55 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  33.33 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  34.68 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  33.52 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.21 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  34.75 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  31.74 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.6 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.15 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.58 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.67 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.37 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal  0.0882014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  23.6 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1959  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.05 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0360363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0879  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.61 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  26.83 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.47 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.47 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.47 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.47 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057687  normal  0.668247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  25.79 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  26.09 
 
 		 227 aa  45.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  21.74 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  21.74 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.45 
 
 		 282 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0849988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  27.14 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5716  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.47 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.35 
 
 		 220 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3920  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.06 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.48 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1430  redoxin domain-containing protein  30.91 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0719986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.12 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  25.95 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  25.95 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  27.91 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  25.95 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2156  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.68 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5359  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.17 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720042  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  25.95 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  25.95 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  25.95 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  25.95 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  25 
 
 		 176 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.67 
 
 		 223 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  26.04 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5141  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.38 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.27 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000412692  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1698  membrane protein  26.63 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.717364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  26.11 
 
 		 210 aa  40.8  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0985  2-cys peroxiredoxin BAS1, (Thiol-specific antioxidant protein)  26.63 
 
 		 199 aa  40.8  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>