61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0905 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
177 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  69.14 
 
 
176 aa  269  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  60.12 
 
 
179 aa  223  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.98 
 
 
178 aa  220  7e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  56.9 
 
 
179 aa  213  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  50.86 
 
 
178 aa  201  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  45.76 
 
 
193 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
179 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.88 
 
 
178 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  36.05 
 
 
168 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  35.29 
 
 
178 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  33.72 
 
 
182 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.21 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.35 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.68 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1128  redoxin  25.2 
 
 
152 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.138715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  23.42 
 
 
195 aa  48.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1235  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.82 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000509525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.83 
 
 
231 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.02 
 
 
212 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0230  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  34.94 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.242968  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 
209 aa  44.7  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.65 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000578338  normal  0.0224191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1418  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.62 
 
 
187 aa  44.7  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0352  redoxin  23.61 
 
 
214 aa  44.3  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0678  hypothetical protein  31.96 
 
 
194 aa  44.3  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182465  unclonable  0.0000000142494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  21.84 
 
 
222 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4880  peroxiredoxin  24 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3454  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  25.68 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.29 
 
 
374 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.22 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.05 
 
 
282 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0849988  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0414  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.12 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.07 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.99 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.71 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.99 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.99 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.99 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  27.35 
 
 
948 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0766  peroxiredoxin  26.44 
 
 
155 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  17.98 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  17.98 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1755  redoxin  24.39 
 
 
218 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1430  redoxin domain-containing protein  30.19 
 
 
156 aa  42  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0719986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3187  peroxiredoxin  25.19 
 
 
187 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0122  redoxin  23.65 
 
 
151 aa  42  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000117403  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  25 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  17.42 
 
 
215 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1786  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  26.96 
 
 
187 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.998152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1072  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  26.96 
 
 
187 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0779  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  26.96 
 
 
187 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.867109  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2046  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  26.96 
 
 
187 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2045  alkyl hydroperoxide reductase protein  26.96 
 
 
187 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0757  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  26.96 
 
 
187 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0667  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  26.96 
 
 
187 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.830328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2520  Redoxin domain protein  23.78 
 
 
203 aa  41.2  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4240  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.59 
 
 
193 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  27.83 
 
 
211 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4302  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.59 
 
 
191 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.111782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>