71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2448 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.14 
 
 		 177 aa  269  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  66.47 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  60.92 
 
 		 179 aa  228  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.88 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  49.71 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  49.13 
 
 		 193 aa  187  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  34.44 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.93 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.93 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  33.74 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.52 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  37.24 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.98 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.2 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  27.27 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  31.52 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  19.89 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  19.89 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  19.13 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  24.77 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.56 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1128  redoxin  25.2 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.138715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  22.1 
 
 		 215 aa  48.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.96 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  23.08 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.31 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.31 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.31 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.31 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.7 
 
 		 231 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  30.93 
 
 		 261 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  34.78 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  34.78 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  25.98 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4880  peroxiredoxin  24.81 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  34.78 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  30.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0618  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  24.34 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  33.33 
 
 		 212 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3454  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  25.69 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1472  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.43 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000866055  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  28.57 
 
 		 217 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4031  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.1 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  21.93 
 
 		 227 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3466  peroxiredoxin  31.88 
 
 		 211 aa  41.6  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.65 
 
 		 225 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  26.09 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  26.09 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0704  Peroxidase  33.33 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0999966 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1430  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0719986  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0770  Peroxidase  33.33 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142805 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  26.09 
 
 		 202 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  26.09 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  26.09 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  26.09 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  26.09 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  28.99 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  28.99 
 
 		 212 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  28.99 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  33.33 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  26.09 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>