40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4180 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  84.07 
 
 		 182 aa  316  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.54 
 
 		 178 aa  241  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  59.32 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.05 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.45 
 
 		 179 aa  197  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  44.19 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.05 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  33.89 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.72 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  32.78 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  32.04 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  36.26 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  33.1 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.82 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.12 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.3 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.3 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.74 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.16 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2184  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.34 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2365  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.03 
 
 		 149 aa  45.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  25.17 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.98 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0230  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  33.77 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.242968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1715  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.13 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.267928  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0879  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.41 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  25.17 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057687  normal  0.668247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  24.31 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5716  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.13 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0234  redoxin  24.57 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.62 
 
 		 282 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0849988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 		 212 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0205  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  32 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.830978  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5359  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.96 
 
 		 226 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720042  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4916  thioredoxin peroxidase (AhpC, Alkyl hydroperoxide reductase)  30.56 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.03 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  30.26 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.16 
 
 		 148 aa  40.8  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>