99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06328 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  373  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  66.48 
 
 
179 aa  262  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  66.47 
 
 
176 aa  242  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.91 
 
 
178 aa  236  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.9 
 
 
177 aa  213  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  55.56 
 
 
178 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  48.3 
 
 
193 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  36.26 
 
 
182 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  34.88 
 
 
168 aa  104  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.53 
 
 
179 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  36.26 
 
 
182 aa  94.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.66 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  36.53 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.75 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.91 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1128  redoxin  26.96 
 
 
152 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.138715  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0090  peptidase C60, sortase A and B  24.44 
 
 
185 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  22.89 
 
 
222 aa  51.2  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1413  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.81 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0354394 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  21.21 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2535  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.52 
 
 
157 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  26.79 
 
 
227 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0766  peroxiredoxin  24.81 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  27.41 
 
 
211 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.03 
 
 
212 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  21.21 
 
 
215 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  21.21 
 
 
215 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.88 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2928  Peroxidase  27.64 
 
 
211 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.625084  hitchhiker  0.00123235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1893  bacterioferritin comigratory protein  30 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670831 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  23.03 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  21.8 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1400  bacterioferritin comigratory protein  21.94 
 
 
152 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.72 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4031  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
191 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4120  redoxin domain-containing protein  24.82 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585528  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2360  bacterioferritin comigratory protein  25.93 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.284107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1322  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.12 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2683  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.19 
 
 
157 aa  45.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.399218  normal  0.169075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12542  bacterioferritin comigratory protein bcp  25.23 
 
 
157 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000415543  hitchhiker  0.00456556 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 
166 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.85 
 
 
223 aa  45.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3644  redoxin  25.23 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3657  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.23 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.517084  normal  0.0138623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3717  redoxin domain-containing protein  25.23 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.050319  normal  0.718647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.06 
 
 
225 aa  44.7  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.15 
 
 
223 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  24.71 
 
 
211 aa  44.3  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.32 
 
 
231 aa  44.3  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10030  Peroxiredoxin  27.78 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.499307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2815  redoxin domain-containing protein  27.12 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.34 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2440  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.74 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0611972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0407  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.11 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  29.91 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.91 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0274  redoxin  23.37 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12323  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  26.47 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1362  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.28 
 
 
162 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2857  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122624  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.29 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.77 
 
 
231 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  26.51 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.29 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0565  bacterioferritin comigratory protein  26.62 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.509018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2636  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.29 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2725  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2750  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2684  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29090  Peroxiredoxin  26.04 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.29 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0352  redoxin  24.2 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  26.13 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.5 
 
 
154 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1677  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.84 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2976  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.22 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000412692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.09 
 
 
223 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1189  Peroxiredoxin  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02372  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02334  hypothetical protein  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3702  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2852  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2627  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1196  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3881  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
153 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2762  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2612  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  29.52 
 
 
156 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07230  Peroxiredoxin  26.17 
 
 
158 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0397395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0560  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.9 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.26632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0954  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.47 
 
 
155 aa  41.6  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1749  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  27.17 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.964388  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  21.97 
 
 
187 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1180  Peroxiredoxin  28.89 
 
 
153 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3511  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  31.11 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191782  normal  0.834672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1245  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  28.57 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.458747  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3130  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  28.57 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.276659  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2937  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.11 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>