60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0508 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
178 aa  366  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  73.6 
 
 
178 aa  280  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.47 
 
 
181 aa  244  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  65.54 
 
 
182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  65.54 
 
 
182 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.84 
 
 
179 aa  174  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  41.86 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.34 
 
 
178 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.88 
 
 
177 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  37.93 
 
 
176 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  31.61 
 
 
178 aa  97.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  32.95 
 
 
193 aa  95.5  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  34.66 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  28.74 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.14 
 
 
231 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.99 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  28.22 
 
 
227 aa  55.1  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
212 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.15 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  29.46 
 
 
222 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.4 
 
 
223 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  23.46 
 
 
211 aa  51.2  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  21.97 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2683  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.31 
 
 
157 aa  49.3  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.399218  normal  0.169075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1472  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.04 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000866055  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
231 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.16 
 
 
223 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  24.78 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  24.78 
 
 
215 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  25.66 
 
 
215 aa  47  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3920  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.22 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264778  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.83 
 
 
282 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0849988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0232  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.1 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0970667 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0356  anti-oxidant AhpCTSA family protein  25.5 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.823101  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1178  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.71 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00466333  normal  0.193954 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0985  2-cys peroxiredoxin BAS1, (Thiol-specific antioxidant protein)  26.53 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1698  membrane protein  26.53 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.717364  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1624  anti-oxidant AhpCTSA family protein  25.5 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0379  anti-oxidant AhpCTSA family protein  25.5 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2184  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.84 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755156  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1852  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.75 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.599333 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1332  alkyl hydroperoxide reductase C22 protein, AhpC/TsaA family  23.49 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0205  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  27.71 
 
 
148 aa  42  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.830978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1619  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.68 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.022951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2973  peroxiredoxin  29.68 
 
 
153 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.42 
 
 
148 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1015  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.81 
 
 
200 aa  41.2  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0678  hypothetical protein  35.38 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182465  unclonable  0.0000000142494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3294  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.81 
 
 
200 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.680689  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0252  alkyl hydroperoxide reductase TsaA  25.75 
 
 
198 aa  41.2  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.241271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.04 
 
 
226 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.330524  normal  0.0882014 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  30.26 
 
 
178 aa  40.8  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.81 
 
 
182 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0122  redoxin  27.45 
 
 
151 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000117403  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  29.33 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>