59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1912 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1912  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  371  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4180  hypothetical protein  84.07 
 
 		 182 aa  316  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.54 
 
 		 178 aa  241  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6336  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  63.95 
 
 		 181 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2036  redoxin  58.19 
 
 		 178 aa  224  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2558  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.93 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01275  hypothetical protein  44.77 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1255  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.72 
 
 		 178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.81 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3592  thioredoxin peroxidase  36.47 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.845386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2448  redoxin domain-containing protein  34.44 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06328  hypothetical protein  36.26 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4087  redoxin  31.64 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03139  thioredoxin peroxidase  30.73 
 
 		 178 aa  95.5  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.957442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.13 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  24.58 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  25.28 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4080  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 282 aa  51.6  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0849988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.16 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4357  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.16 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0352  redoxin  25.95 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.9 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0258  AhpC/TSA family protein  31.58 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3245  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.05 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.05 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.05 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.025666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3092  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.05 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1094  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.83 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.606072  normal  0.791577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2184  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4963  peroxidase  28.8 
 
 		 219 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419029  hitchhiker  0.00950513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.36 
 
 		 225 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2991  redoxin domain-containing protein  24.79 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0230  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  29.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.242968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1098  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.81 
 
 		 223 aa  44.7  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.47 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0678  hypothetical protein  30.77 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182465  unclonable  0.0000000142494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0879  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5359  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720042  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  23.97 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1381  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0205  bacterioferritin comigratory protein, thiol peroxidase, putative  29.11 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.830978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2365  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.57 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5716  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5038  1-Cys peroxiredoxin  52.94 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.96 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.057687  normal  0.668247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0766  peroxiredoxin  32.47 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2426  hypothetical protein  32.56 
 
 		 117 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1639  Peroxidase  29.6 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.160571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3229  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.7 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.898386  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2811  redoxin domain-containing protein  24.42 
 
 		 215 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2894  redoxin domain-containing protein  24.42 
 
 		 215 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  29.27 
 
 		 222 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0777  peroxidase  25.18 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.409644  normal  0.136883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2552  redoxin domain-containing protein  32 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000966633  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.87 
 
 		 148 aa  41.6  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0759  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.631395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>