More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0789 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0789  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.644602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  76.34 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2231  intracellular protease, PfpI family  51.69 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1373  intracellular protease, PfpI family  48.72 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228619  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2501  intracellular protease, PfpI family  44.54 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.248652  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  45.97 
 
 		 194 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0349  intracellular protease, PfpI family  47.66 
 
 		 186 aa  111  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  46.28 
 
 		 197 aa  110  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  48.76 
 
 		 199 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3803  intracellular protease, PfpI family  46.34 
 
 		 198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  46.51 
 
 		 195 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  46.61 
 
 		 187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  45.97 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  45.97 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  45.53 
 
 		 198 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  48.28 
 
 		 193 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  42.5 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  43.9 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2859  intracellular protease, PfpI family  41.13 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  45.38 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  43.55 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  46.4 
 
 		 201 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3047  intracellular protease, PfpI family  41.13 
 
 		 199 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3237  intracellular protease, PfpI family  41.13 
 
 		 200 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  43.55 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0998  PfpI family intracellular peptidase  41.94 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  41.94 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  41.13 
 
 		 192 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0902  peptidase C56, PfpI  43.31 
 
 		 191 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0298  intracellular protease, PfpI family  43.2 
 
 		 192 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4093  intracellular protease, PfpI family  38.76 
 
 		 191 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  40.32 
 
 		 209 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0549  intracellular protease, PfpI family  41.6 
 
 		 195 aa  97.8  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  44.83 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2996  PfpI family intracellular peptidase  38.36 
 
 		 192 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0734954  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1145  PfpI family intracellular peptidase  46.49 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  41.54 
 
 		 193 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  44.07 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2087  peptidase C56, PfpI  43.55 
 
 		 193 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2009  intracellular protease, PfpI family  42.98 
 
 		 198 aa  94.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3932  PfpI family intracellular peptidase  41.94 
 
 		 193 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3045  PfpI family intracellular peptidase  40.35 
 
 		 184 aa  94  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000681061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3274  PfpI family intracellular peptidase  41.67 
 
 		 193 aa  94  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  41.88 
 
 		 195 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  41.88 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3280  intracellular protease, PfpI family  41.13 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.94363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1262  PfpI family intracellular peptidase  39.68 
 
 		 195 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3866  PfpI family intracellular peptidase  40.65 
 
 		 193 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  39.52 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0025  peptidase C56, PfpI  38.71 
 
 		 193 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  41.03 
 
 		 192 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37700  cysteine peptidase PfpI protein  40.83 
 
 		 206 aa  91.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1150  intracellular protease, PfpI family  38.36 
 
 		 192 aa  90.5  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0363  intracellular protease, PfpI family  40.3 
 
 		 192 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0347  peptidase C56, PfpI  41.13 
 
 		 192 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  38.46 
 
 		 193 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  37.9 
 
 		 193 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0996  PfpI family intracellular peptidase  37.9 
 
 		 192 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  hitchhiker  0.000000851254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3031  intracellular protease, PfpI family  41.18 
 
 		 195 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.719779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2424  PfpI family intracellular peptidase  39.2 
 
 		 191 aa  87  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486342  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  45.3 
 
 		 187 aa  87  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1604  intracellular protease, PfpI family  36.29 
 
 		 193 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2558  intracellular protease, PfpI family  36.89 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1402  intracellular protease, PfpI family  40 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1960  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  36 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  43.59 
 
 		 197 aa  85.5  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1245  intracellular protease, PfpI family  42.15 
 
 		 193 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56370  hypothetical protein  36.29 
 
 		 194 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4906  hypothetical protein  37.1 
 
 		 193 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  41.03 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  38.33 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7251  intracellular protease, PfpI family  37.1 
 
 		 193 aa  84.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0247532  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2475  PfpI family intracellular peptidase  40.91 
 
 		 189 aa  84.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  38.33 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  43.7 
 
 		 186 aa  84  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  37.5 
 
 		 193 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  41.03 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0330  intracellular protease, PfpI family  43.97 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2946  PfpI family intracellular peptidase  38.98 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1532  PfpI family intracellular peptidase  40.71 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  39.5 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  41.18 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1954  hypothetical protein  31.08 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0930  peptidase C56, PfpI  40.16 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0223631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1378  ThiJ/PfpI family protein  35.94 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2130  PfpI family intracellular peptidase  38.66 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.334013  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0556  PfpI family intracellular peptidase  37.1 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1994  PfpI family intracellular peptidase  36.67 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000215331  normal  0.308475 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2660  PfpI family intracellular peptidase  36.92 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  44.95 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2793  PfpI family intracellular peptidase  36.92 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1169  peptidase C56, PfpI  37.39 
 
 		 255 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  43.1 
 
 		 189 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  40.87 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  40.52 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  43.1 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2815  PfpI family intracellular peptidase  35.16 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2898  PfpI family intracellular peptidase  35.16 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  41.88 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>