More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4616 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4616  enolase  100 
 
 		 427 aa  875    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1482  phosphopyruvate hydratase  99.77 
 
 		 427 aa  873    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.379573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06630  enolase  64.4 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0763  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 430 aa  542  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.682175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  60.99 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1018  phosphopyruvate hydratase  60.38 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0970  enolase  62.06 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.407094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  59.53 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  59.86 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  59.15 
 
 		 428 aa  521  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  60.94 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_533  enolase  59.29 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  61.96 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 		 429 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1101  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.476094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  59.15 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  60.52 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  59.1 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  60.28 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  59.25 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  59.25 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 		 430 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  58.73 
 
 		 428 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  58.63 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  61.18 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  57.82 
 
 		 422 aa  504  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  60.71 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  58.73 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  58.33 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 427 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  61.19 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  61.41 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  59.34 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  57.92 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  60.99 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  59.06 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  60.76 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  58.25 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  58.63 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  59.1 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  57.78 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  58.71 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  58.25 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2603  enolase  59.91 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  61.65 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  58.61 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  60.76 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  60.24 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  58.35 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  57.24 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  59.1 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  58.57 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  56.88 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  58.49 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  58.51 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  58.59 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  59.57 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  57.89 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  58.7 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  58.49 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  57.58 
 
 		 430 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  57.41 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  58.39 
 
 		 427 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2195  enolase  58.17 
 
 		 426 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000497652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  58.04 
 
 		 435 aa  485  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  55.08 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  60.28 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  60.28 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  58.16 
 
 		 426 aa  487  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  57.45 
 
 		 426 aa  484  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  58.63 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  56.74 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  59.57 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  58.96 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  57.28 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  56.8 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  58.16 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  57.24 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  58.37 
 
 		 425 aa  481  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  58.87 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  57.55 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  58.63 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  58.73 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  57.76 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  57.68 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  57.14 
 
 		 428 aa  481  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  56.97 
 
 		 429 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  59.62 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  58.73 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  58.25 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  58.73 
 
 		 429 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  56.74 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  55.04 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  56.83 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  55.82 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>