More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0701 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05865  enolase  75 
 
 		 428 aa  651    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  79.01 
 
 		 430 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 431 aa  880    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  74.11 
 
 		 430 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 		 434 aa  628  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  72.13 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  69.84 
 
 		 430 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  71.6 
 
 		 423 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  67.74 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.99 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  66.97 
 
 		 433 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1824  phosphopyruvate hydratase  70.57 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  68.16 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  66.04 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  68.53 
 
 		 426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 425 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 425 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  67.69 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 		 427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.51 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  65.96 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  63.82 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 431 aa  554  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  63.34 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  64.4 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.06 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  63.23 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.11 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  62.7 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  64.94 
 
 		 428 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  61.45 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.02 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  63.82 
 
 		 430 aa  551  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  64.27 
 
 		 433 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  64.06 
 
 		 437 aa  547  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  63.13 
 
 		 437 aa  545  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  66.04 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  61.86 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 		 427 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  64.9 
 
 		 437 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 		 427 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  65.4 
 
 		 431 aa  541  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  62.17 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 		 424 aa  541  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  62.9 
 
 		 432 aa  541  1e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  63.38 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 		 425 aa  541  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 		 426 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>