More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5032 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5032  enolase  100 
 
 
426 aa  875    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  82.86 
 
 
423 aa  722    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  77.07 
 
 
427 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  68.78 
 
 
427 aa  621  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  69.86 
 
 
430 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 
431 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
437 aa  588  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.06 
 
 
431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  68.24 
 
 
430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  66.05 
 
 
437 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  65.06 
 
 
437 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  65.82 
 
 
437 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  69.95 
 
 
430 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  65.9 
 
 
437 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  65.36 
 
 
437 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  68.08 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 
430 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 
430 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
431 aa  565  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
431 aa  565  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  67.37 
 
 
428 aa  567  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.47 
 
 
430 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2603  enolase  66.51 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
433 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
422 aa  561  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.24 
 
 
429 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 
433 aa  556  1e-157  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  65.64 
 
 
431 aa  555  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
428 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
426 aa  552  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.18 
 
 
428 aa  553  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 
433 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 
434 aa  548  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
425 aa  548  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  64.22 
 
 
426 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
427 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  62.35 
 
 
432 aa  546  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
429 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0309  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 
437 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000038709  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  65.72 
 
 
426 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
425 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.38 
 
 
431 aa  541  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  62.26 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
428 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  63.42 
 
 
427 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  62.3 
 
 
435 aa  539  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  60.76 
 
 
425 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 
425 aa  538  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
431 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  62.65 
 
 
422 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
428 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  535  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
424 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 
427 aa  534  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
429 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  62.17 
 
 
427 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
426 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  62.17 
 
 
431 aa  531  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
430 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  61.23 
 
 
427 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
429 aa  531  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  60.7 
 
 
434 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  60.7 
 
 
434 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
425 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  60.7 
 
 
434 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  60.19 
 
 
429 aa  528  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
425 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  61.7 
 
 
429 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
425 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
429 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 
428 aa  525  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  62.17 
 
 
427 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
427 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
425 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  59.72 
 
 
429 aa  525  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  59.72 
 
 
429 aa  526  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 
424 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
424 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  61.94 
 
 
427 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>