More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1184 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1470  enolase  79.91 
 
 		 425 aa  667    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 426 aa  860    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  72.77 
 
 		 427 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  69.72 
 
 		 427 aa  609  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  71.36 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  70.26 
 
 		 428 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  70.42 
 
 		 427 aa  606  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  72.34 
 
 		 426 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  71.19 
 
 		 428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  70.96 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  70.02 
 
 		 428 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  70.02 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  70.26 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  69.58 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  69.25 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  69.01 
 
 		 427 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  68.38 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  69.68 
 
 		 433 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  71.13 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  68.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  67.84 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  67.14 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.62 
 
 		 424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  69.21 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1839  phosphopyruvate hydratase  70.19 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0962098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1452  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 430 aa  569  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 424 aa  564  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 425 aa  564  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0619  enolase  67.75 
 
 		 431 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  65.42 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 438 aa  560  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43350  Enolase  67.45 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0920843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0664  enolase  70.35 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 438 aa  559  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45760  Enolase  67.45 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.894682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 429 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49970  Enolase  67.45 
 
 		 439 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.917333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22210  Enolase  67.21 
 
 		 437 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3033  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.427825  hitchhiker  0.00539461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 		 425 aa  554  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.72 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>