More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1091 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  84.85 
 
 
428 aa  733    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  91.61 
 
 
427 aa  781    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  90.21 
 
 
427 aa  775    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  82.33 
 
 
428 aa  708    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  81.12 
 
 
427 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
429 aa  875    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  77.41 
 
 
427 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  81.82 
 
 
427 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  767    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  83.49 
 
 
428 aa  722    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  80.14 
 
 
433 aa  719    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  74.83 
 
 
427 aa  671    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  81.12 
 
 
427 aa  727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  81.82 
 
 
427 aa  731    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  88.81 
 
 
427 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  75.29 
 
 
427 aa  683    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  83.92 
 
 
427 aa  726    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  89.98 
 
 
427 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  83.72 
 
 
428 aa  745    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  89.51 
 
 
427 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  96.27 
 
 
429 aa  830    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  88.81 
 
 
427 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  89.28 
 
 
427 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  83.26 
 
 
428 aa  740    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  84.62 
 
 
428 aa  734    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  92.31 
 
 
427 aa  788    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  92.54 
 
 
427 aa  790    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  88.81 
 
 
427 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  83.02 
 
 
428 aa  738    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  78.84 
 
 
428 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  89.28 
 
 
427 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  81.35 
 
 
427 aa  695    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  89.28 
 
 
427 aa  768    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  89.04 
 
 
427 aa  765    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  69 
 
 
430 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 
430 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 
430 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  68.3 
 
 
429 aa  616  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 
428 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
429 aa  608  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  69.25 
 
 
430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.9 
 
 
431 aa  598  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  68.84 
 
 
429 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  68.14 
 
 
428 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  593  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  69.46 
 
 
429 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
431 aa  591  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 
428 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
431 aa  593  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  69.46 
 
 
429 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  69 
 
 
429 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 
429 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 
429 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  69 
 
 
429 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 
429 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  69 
 
 
429 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 
429 aa  588  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  66.43 
 
 
426 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03083  phosphopyruvate hydratase  71.9 
 
 
430 aa  587  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00104366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
427 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
426 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  68.3 
 
 
429 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
425 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  62.7 
 
 
432 aa  580  1e-164  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 
433 aa  580  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  70.02 
 
 
431 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  68.07 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1363  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.5 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  66.04 
 
 
426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 
430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  63.99 
 
 
437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4106  phosphopyruvate hydratase  67.68 
 
 
432 aa  571  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0619  enolase  67.83 
 
 
431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 
431 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>