More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4165 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02624  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000285005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0909  Phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107152  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3149  phosphopyruvate hydratase  74.19 
 
 		 432 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00318163  normal  0.304263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 429 aa  867    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3266  phosphopyruvate hydratase  73.95 
 
 		 432 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  0.113056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  92.54 
 
 		 429 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1237  phosphopyruvate hydratase  79.02 
 
 		 431 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00127737  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1205  phosphopyruvate hydratase  79.25 
 
 		 431 aa  684    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000056862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3440  enolase  80.76 
 
 		 398 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  89.51 
 
 		 428 aa  765    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3110  phosphopyruvate hydratase  74.19 
 
 		 432 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3168  phosphopyruvate hydratase  74.19 
 
 		 432 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00128116  normal  0.40591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0852  phosphopyruvate hydratase  74.19 
 
 		 432 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2757  phosphopyruvate hydratase  79.25 
 
 		 431 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.434874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1363  phosphopyruvate hydratase  90.44 
 
 		 428 aa  771    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3446  phosphopyruvate hydratase  74.19 
 
 		 431 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  91.14 
 
 		 429 aa  787    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3136  phosphopyruvate hydratase  79.02 
 
 		 431 aa  676    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00228262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0933  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  93.24 
 
 		 429 aa  800    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3350  phosphopyruvate hydratase  78.32 
 
 		 431 aa  675    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000582829  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02586  hypothetical protein  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000255384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4039  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102498  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3094  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269583  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 429 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1185  phosphopyruvate hydratase  77.86 
 
 		 431 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03083  phosphopyruvate hydratase  77.86 
 
 		 430 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00104366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  99.53 
 
 		 429 aa  864    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2923  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1245  enolase  76.64 
 
 		 428 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00208241  normal  0.787599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3316  phosphopyruvate hydratase  74.19 
 
 		 431 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.031619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1196  phosphopyruvate hydratase  78.32 
 
 		 431 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.061056  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3279  phosphopyruvate hydratase  79.25 
 
 		 431 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0619  enolase  76.22 
 
 		 431 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3083  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2917  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 432 aa  654    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0019531  normal  0.702822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1290  phosphopyruvate hydratase  78.09 
 
 		 431 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000272056 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  76.69 
 
 		 430 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3233  phosphopyruvate hydratase  73.72 
 
 		 431 aa  641    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0388546  normal  0.0683128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  75.41 
 
 		 433 aa  658    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1115  phosphopyruvate hydratase  79.72 
 
 		 431 aa  685    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00458035  normal  0.795235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1186  phosphopyruvate hydratase  79.72 
 
 		 431 aa  685    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0854743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3085  phosphopyruvate hydratase  74.19 
 
 		 432 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000118024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  92.54 
 
 		 429 aa  789    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  99.53 
 
 		 429 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0979  phosphopyruvate hydratase  73.95 
 
 		 431 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3033  phosphopyruvate hydratase  90.21 
 
 		 429 aa  753    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.427825  hitchhiker  0.00539461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0818  phosphopyruvate hydratase  73.95 
 
 		 432 aa  643    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1116  phosphopyruvate hydratase  79.95 
 
 		 431 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3127  phosphopyruvate hydratase  79.25 
 
 		 431 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172758  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  80.33 
 
 		 431 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  79.95 
 
 		 431 aa  680    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1052  phosphopyruvate hydratase  74.94 
 
 		 433 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.37483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0795  phosphopyruvate hydratase  73.95 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.666938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3545  phosphopyruvate hydratase  73.95 
 
 		 431 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  72.6 
 
 		 438 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3386  phosphopyruvate hydratase  73.72 
 
 		 431 aa  627  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0680089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2025  phosphopyruvate hydratase  73.32 
 
 		 433 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43350  Enolase  74.4 
 
 		 438 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0920843  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  72.13 
 
 		 438 aa  627  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27220  Enolase  74.16 
 
 		 437 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2514  enolase  74.01 
 
 		 432 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45760  Enolase  74.4 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.894682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49970  Enolase  74.4 
 
 		 439 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.917333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22210  Enolase  74.16 
 
 		 437 aa  624  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  71.26 
 
 		 438 aa  621  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0561  phosphopyruvate hydratase  72.85 
 
 		 433 aa  624  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.658237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4106  phosphopyruvate hydratase  72.85 
 
 		 432 aa  620  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002507  enolase  73.32 
 
 		 433 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000898195  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03525  phosphopyruvate hydratase  73.32 
 
 		 433 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  70.73 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  70.49 
 
 		 427 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0669  phosphopyruvate hydratase  74.01 
 
 		 435 aa  599  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000208326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  69.32 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  69 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  69 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  67.45 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  68.62 
 
 		 428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1850  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 422 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  68.62 
 
 		 428 aa  581  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  67.68 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0221  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 433 aa  580  1e-164  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.713905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.81 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>