More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2987 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  75.23 
 
 		 428 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  76.64 
 
 		 429 aa  676    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  73.49 
 
 		 431 aa  648    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  79.53 
 
 		 426 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  72.33 
 
 		 431 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  72.33 
 
 		 431 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  72.56 
 
 		 431 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 428 aa  862    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  73.36 
 
 		 429 aa  634    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  72.33 
 
 		 431 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  91.33 
 
 		 427 aa  798    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  73.52 
 
 		 425 aa  651    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  76.11 
 
 		 428 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  78.17 
 
 		 428 aa  662    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  76.06 
 
 		 434 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  77.39 
 
 		 430 aa  682    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  73.6 
 
 		 429 aa  643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  71.93 
 
 		 431 aa  641    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  71.93 
 
 		 431 aa  641    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  72.33 
 
 		 431 aa  641    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  73.66 
 
 		 430 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  71.87 
 
 		 425 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  73.6 
 
 		 429 aa  643    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  72.33 
 
 		 431 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  78.09 
 
 		 430 aa  686    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  74.77 
 
 		 429 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  71.73 
 
 		 428 aa  631  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  73.02 
 
 		 431 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  73.02 
 
 		 431 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  73.88 
 
 		 433 aa  626  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  72.79 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  72.79 
 
 		 431 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  72.09 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  68.3 
 
 		 429 aa  618  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  70.86 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  71.96 
 
 		 429 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  68.52 
 
 		 434 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  68.24 
 
 		 427 aa  614  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 		 431 aa  608  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  68.06 
 
 		 434 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  68.06 
 
 		 434 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  69.61 
 
 		 432 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  71.63 
 
 		 426 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 425 aa  601  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  68.89 
 
 		 435 aa  599  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 427 aa  594  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 		 432 aa  595  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  67.68 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  68.31 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  70.24 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.57 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  69.78 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  68.53 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 425 aa  584  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  584  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.5 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 422 aa  587  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  69.01 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 429 aa  584  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  69.01 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 		 429 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  68.1 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  65.82 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 426 aa  581  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  67.83 
 
 		 430 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  65.11 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>