More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0358 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  72.49 
 
 		 429 aa  635    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  100 
 
 		 429 aa  876    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  72.49 
 
 		 430 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  71.79 
 
 		 430 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  71.16 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  72.03 
 
 		 430 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  71.16 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  623  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  70.4 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  71.16 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  71.16 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  67.37 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  70.47 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  70.93 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2794  enolase  71.96 
 
 		 430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  68.76 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19670  enolase  71.5 
 
 		 434 aa  599  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  69.46 
 
 		 428 aa  595  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  68.85 
 
 		 426 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  67.6 
 
 		 432 aa  588  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  69.16 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  70.73 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  68.45 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  65.58 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  65.5 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 433 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  64.9 
 
 		 434 aa  570  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.35 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  65.5 
 
 		 426 aa  567  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  65.59 
 
 		 435 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 433 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.47 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.05 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.05 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 		 433 aa  555  1e-157  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  63.95 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1650  enolase  65.52 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  65.5 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  63.02 
 
 		 428 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  63.02 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.71 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  65.97 
 
 		 426 aa  551  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  63.82 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  64.88 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  62.7 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 428 aa  551  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  65.26 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 		 433 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  63.82 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.17 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>