More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0201 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1036  enolase  79.58 
 
 
430 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  78.74 
 
 
427 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  75.71 
 
 
427 aa  642    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 
427 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  75.71 
 
 
426 aa  639    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  78.04 
 
 
427 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  77.83 
 
 
426 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  78.69 
 
 
428 aa  655    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  79.01 
 
 
429 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  79.48 
 
 
426 aa  667    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  78.74 
 
 
428 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  81.6 
 
 
425 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  76.17 
 
 
429 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  76.17 
 
 
429 aa  653    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  75.24 
 
 
426 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  75.71 
 
 
426 aa  639    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  76.87 
 
 
427 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  77.36 
 
 
426 aa  654    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  76.36 
 
 
431 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 
427 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
428 aa  865    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  79.25 
 
 
425 aa  670    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  76.17 
 
 
429 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  73.41 
 
 
426 aa  632  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  76.17 
 
 
429 aa  628  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  76.65 
 
 
428 aa  627  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  76.17 
 
 
429 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  75.24 
 
 
425 aa  621  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  75.71 
 
 
429 aa  621  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  74.82 
 
 
428 aa  620  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  71.29 
 
 
427 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  73.65 
 
 
427 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  76.4 
 
 
429 aa  609  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4431  enolase  74.12 
 
 
431 aa  604  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.117661  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  71.96 
 
 
430 aa  600  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 
429 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  68.74 
 
 
426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 
425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
425 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  67.85 
 
 
428 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 
429 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 
429 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  66.91 
 
 
427 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
429 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
427 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
425 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
425 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 
429 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 
429 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
429 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
425 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
433 aa  561  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
422 aa  558  1e-158  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 
428 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 
425 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
429 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
430 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
429 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 
425 aa  555  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
430 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
425 aa  551  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  66.11 
 
 
428 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 
425 aa  551  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
427 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
427 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
425 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
427 aa  552  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  68.41 
 
 
424 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  65.25 
 
 
427 aa  554  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
426 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
429 aa  549  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
424 aa  548  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 
428 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
427 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  65.41 
 
 
429 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  67.46 
 
 
425 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 
428 aa  548  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
424 aa  549  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3486  Phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 
426 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194771  normal  0.960022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
429 aa  548  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.03 
 
 
431 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.03 
 
 
431 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  67.85 
 
 
437 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
429 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1687  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 
430 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
425 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
427 aa  547  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
425 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
426 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
425 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 
427 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
431 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.29 
 
 
429 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  66.19 
 
 
426 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>