More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0003 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0003  enolase  82.94 
 
 
422 aa  702    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  100 
 
 
424 aa  850    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  73.57 
 
 
422 aa  621  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 
433 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
429 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  67.61 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  68.08 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
431 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
430 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 
430 aa  568  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
430 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
429 aa  565  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 
429 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 
431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 
431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 
427 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
429 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  68.92 
 
 
430 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
429 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
429 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 
428 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
426 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 
434 aa  558  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  64.47 
 
 
425 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
429 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
429 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
428 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 
428 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  63.83 
 
 
426 aa  556  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
427 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
427 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
429 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  67.14 
 
 
426 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  64.83 
 
 
423 aa  556  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 
433 aa  554  1e-156  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 
431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  64.13 
 
 
423 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
430 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 
426 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 
431 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
433 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
424 aa  551  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  551  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
432 aa  554  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
426 aa  551  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.24 
 
 
429 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  64.22 
 
 
426 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 
430 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
433 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 
426 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  63.36 
 
 
427 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 
437 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
427 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 
430 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  65.55 
 
 
437 aa  550  1e-155  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
424 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  63.15 
 
 
431 aa  551  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
431 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
425 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  63.51 
 
 
430 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  61.65 
 
 
431 aa  545  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 
427 aa  544  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
428 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  63.16 
 
 
437 aa  547  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 
430 aa  544  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  61.41 
 
 
427 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 
425 aa  547  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
425 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
425 aa  545  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  64.08 
 
 
429 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
425 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 
428 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
425 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  64.11 
 
 
424 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 
427 aa  543  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
425 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
427 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
427 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  62.7 
 
 
437 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
427 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>