More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1885 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  74.59 
 
 		 425 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  72.94 
 
 		 425 aa  636    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  76.24 
 
 		 426 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  74.29 
 
 		 425 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  74.59 
 
 		 424 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 425 aa  857    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  73.11 
 
 		 430 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  74.29 
 
 		 425 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  73.88 
 
 		 425 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 		 426 aa  659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  76 
 
 		 424 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 		 427 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  72.17 
 
 		 427 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  74.35 
 
 		 424 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 427 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  72 
 
 		 425 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  74.59 
 
 		 424 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  74.59 
 
 		 425 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 		 429 aa  624  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 		 424 aa  621  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  73.11 
 
 		 427 aa  621  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  73.58 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  73.58 
 
 		 425 aa  621  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  74.76 
 
 		 424 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  73.11 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 425 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  72.42 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  72.24 
 
 		 424 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  70.99 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  71.23 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  70.75 
 
 		 427 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  70.28 
 
 		 426 aa  610  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  72.34 
 
 		 424 aa  608  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  70.41 
 
 		 423 aa  605  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  71.97 
 
 		 428 aa  604  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  69.18 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  69.12 
 
 		 430 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  69.43 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  69.43 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  69.67 
 
 		 431 aa  596  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  69.43 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  69.43 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  69.67 
 
 		 431 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.97 
 
 		 427 aa  591  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  70.69 
 
 		 437 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  69.67 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 430 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  69.67 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  69.67 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  69.43 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  68.65 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  67.7 
 
 		 430 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  68.01 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  68.65 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  69.05 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  67.62 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  69.27 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 425 aa  574  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  67.54 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  69.21 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  68.63 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 		 429 aa  564  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>