More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1305 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  72.56 
 
 		 430 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1650  enolase  74.31 
 
 		 448 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 432 aa  886    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0240  phosphopyruvate hydratase  73.72 
 
 		 441 aa  644    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.8527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  71.86 
 
 		 430 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  70.23 
 
 		 430 aa  625  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  70.07 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  70.07 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  70.07 
 
 		 431 aa  615  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  68.3 
 
 		 429 aa  617  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  68.97 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  69.84 
 
 		 431 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  69.61 
 
 		 431 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  67.97 
 
 		 434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  67.83 
 
 		 428 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  67.91 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  66.13 
 
 		 434 aa  588  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 427 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  67.91 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 433 aa  590  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  65.89 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 433 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.35 
 
 		 429 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  67.6 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  66.67 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.42 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  68.46 
 
 		 434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.35 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  62.7 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  66.51 
 
 		 426 aa  564  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  64.37 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.51 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  65.58 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  65.5 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  61.77 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  62.24 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  63.95 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 433 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  61.77 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  61.54 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1722  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 		 432 aa  551  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.53 
 
 		 424 aa  554  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  63.17 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 		 422 aa  553  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  61.54 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  61.77 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  61.77 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  64.65 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  62.33 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>