More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0136 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  71.63 
 
 		 431 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  74.3 
 
 		 428 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  71.4 
 
 		 431 aa  634    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  71.4 
 
 		 431 aa  634    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  71.63 
 
 		 431 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  72.73 
 
 		 430 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  73.13 
 
 		 429 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  73.13 
 
 		 429 aa  634    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  71.4 
 
 		 431 aa  634    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  72.33 
 
 		 431 aa  637    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  71.4 
 
 		 431 aa  634    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  77.18 
 
 		 426 aa  667    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  72.1 
 
 		 425 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  74.71 
 
 		 428 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  76.22 
 
 		 430 aa  666    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  91.33 
 
 		 428 aa  798    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  75.99 
 
 		 430 aa  661    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 427 aa  861    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  75.35 
 
 		 428 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 		 429 aa  665    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  71.63 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  71.63 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 		 425 aa  631  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  71.73 
 
 		 429 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  71.73 
 
 		 429 aa  630  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  74.65 
 
 		 434 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  71.86 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  71.86 
 
 		 431 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  70.56 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  71.63 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  72.09 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  71.63 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  71.76 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  71.26 
 
 		 429 aa  609  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  67.37 
 
 		 429 aa  606  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 		 427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  67.36 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  67.36 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  68.94 
 
 		 431 aa  596  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  68.3 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  67.36 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  67.74 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  67.52 
 
 		 432 aa  594  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  68.76 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  66.9 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 433 aa  588  1e-167  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  69.98 
 
 		 426 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 428 aa  579  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  67.61 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  68.57 
 
 		 433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  65.36 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  64.17 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 		 425 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19670  enolase  67.99 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  67.62 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  64.64 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  67.63 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  66.12 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>