More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0621 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  74 
 
 		 428 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  78.54 
 
 		 428 aa  703    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 428 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  78.3 
 
 		 428 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  76.6 
 
 		 427 aa  670    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  75.18 
 
 		 427 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  74.83 
 
 		 433 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  75.65 
 
 		 427 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  76.83 
 
 		 427 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  77.41 
 
 		 429 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 427 aa  872    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  78.01 
 
 		 427 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  78.07 
 
 		 428 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  77.3 
 
 		 427 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  73.76 
 
 		 428 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  77.59 
 
 		 428 aa  697    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  77.41 
 
 		 427 aa  684    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  75.65 
 
 		 427 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  76.36 
 
 		 427 aa  659    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  77.78 
 
 		 427 aa  696    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  76.6 
 
 		 427 aa  691    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  78.72 
 
 		 427 aa  711    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  78.25 
 
 		 427 aa  685    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  75.41 
 
 		 427 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  77.07 
 
 		 427 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  76.94 
 
 		 429 aa  675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  76.12 
 
 		 427 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  75.65 
 
 		 427 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  76.12 
 
 		 427 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  75.65 
 
 		 427 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  75.89 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  79.01 
 
 		 428 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  76.12 
 
 		 427 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  75.41 
 
 		 427 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  71.06 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  70.02 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  68.71 
 
 		 430 aa  596  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 428 aa  591  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  68.09 
 
 		 426 aa  591  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  68.47 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  67.68 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.71 
 
 		 430 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  68.56 
 
 		 426 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  68.63 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  68.56 
 
 		 426 aa  587  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  68.08 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.59 
 
 		 429 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  69.03 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 422 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  67.63 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 		 425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  65.81 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 431 aa  571  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 429 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 430 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  68.63 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>