More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0078 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
426 aa  867    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 
429 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 
429 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  69.58 
 
 
428 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
428 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 
428 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 
429 aa  584  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 
430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.2 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 
430 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 
429 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
429 aa  580  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.38 
 
 
426 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
427 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 
429 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  68.81 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 
427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  66.98 
 
 
428 aa  569  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
433 aa  569  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
422 aa  568  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
428 aa  571  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.33 
 
 
427 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
427 aa  564  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
425 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.76 
 
 
424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
425 aa  558  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
428 aa  558  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  64.86 
 
 
422 aa  560  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.25 
 
 
428 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.17 
 
 
433 aa  558  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  65.34 
 
 
427 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  64.47 
 
 
428 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  66.27 
 
 
426 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
428 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
428 aa  554  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
425 aa  554  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
430 aa  555  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
428 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 
427 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
434 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
437 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
429 aa  551  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
431 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  64.4 
 
 
431 aa  552  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 
429 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
427 aa  551  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
429 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 
425 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 
429 aa  552  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
431 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
431 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 
432 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  64.39 
 
 
430 aa  552  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 
431 aa  551  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 
427 aa  551  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 
429 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  64.99 
 
 
431 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 
429 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 
428 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
427 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
429 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 
434 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  63.32 
 
 
431 aa  549  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
431 aa  551  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  62.82 
 
 
427 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>