More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0996 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  73.72 
 
 		 429 aa  643    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  74.25 
 
 		 430 aa  654    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  87.38 
 
 		 428 aa  754    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  90.44 
 
 		 429 aa  798    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 429 aa  871    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  78.97 
 
 		 428 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 429 aa  871    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  87.24 
 
 		 431 aa  749    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  89.74 
 
 		 429 aa  767    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  74.48 
 
 		 430 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  73.6 
 
 		 428 aa  658    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  71.73 
 
 		 427 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  85.78 
 
 		 429 aa  740    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  71 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  71 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  71.23 
 
 		 431 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  71.69 
 
 		 430 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  71 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  71 
 
 		 431 aa  627  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  71 
 
 		 431 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  71.83 
 
 		 426 aa  621  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  71.3 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  71.46 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  71.46 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.93 
 
 		 427 aa  614  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  71.46 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  71.23 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  69.56 
 
 		 431 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  69.56 
 
 		 431 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  69.81 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  68.14 
 
 		 429 aa  605  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  67.28 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  67.28 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  68.07 
 
 		 428 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  594  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  68.46 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.36 
 
 		 431 aa  594  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 428 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  67.91 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 427 aa  587  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 		 428 aa  590  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  67.59 
 
 		 432 aa  589  1e-167  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 427 aa  590  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 		 428 aa  590  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  68.33 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 		 422 aa  587  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  70.86 
 
 		 434 aa  584  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  65.9 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  66.51 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  64.95 
 
 		 427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.51 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  65.21 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  66.43 
 
 		 427 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 		 427 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 430 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  65.06 
 
 		 435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 434 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  65.36 
 
 		 433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 		 432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 		 427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 432 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 428 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.86 
 
 		 424 aa  568  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1452  phosphopyruvate hydratase  64.97 
 
 		 430 aa  569  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  65.19 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 437 aa  568  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>