More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1470 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1470  enolase  100 
 
 		 425 aa  867    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  79.91 
 
 		 426 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  69.03 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  70.14 
 
 		 427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  68.08 
 
 		 427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  70.28 
 
 		 426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 		 426 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 		 426 aa  581  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  67.52 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.11 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  65.72 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 427 aa  564  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.81 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1839  phosphopyruvate hydratase  70.09 
 
 		 429 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0962098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  64.9 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0664  enolase  69.27 
 
 		 426 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 		 422 aa  551  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  63.64 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.74 
 
 		 424 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1452  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00171  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 		 430 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  62.94 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  62.94 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 425 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0619  enolase  65.19 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  62.59 
 
 		 425 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 424 aa  541  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 		 431 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 		 429 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  62.23 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  62.23 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 		 429 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0568  phosphopyruvate hydratase  64.47 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  63.23 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 		 433 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 		 428 aa  537  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  63.25 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  61.86 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  63.85 
 
 		 426 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  63.74 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>