More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1452 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00171  phosphopyruvate hydratase  88.37 
 
 		 430 aa  762    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1452  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 430 aa  869    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0568  phosphopyruvate hydratase  84.62 
 
 		 430 aa  719    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0616  phosphopyruvate hydratase  84.15 
 
 		 445 aa  714    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.635755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  67.44 
 
 		 428 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.43 
 
 		 429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 427 aa  578  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.66 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.2 
 
 		 429 aa  574  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  67.36 
 
 		 430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  65.66 
 
 		 438 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  68.72 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  67.13 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.97 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  66.13 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 438 aa  571  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  66.05 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  65.43 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  64.88 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  67.13 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.97 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.97 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 426 aa  568  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  64.34 
 
 		 426 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.5 
 
 		 429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1839  phosphopyruvate hydratase  68.6 
 
 		 429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0962098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.65 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.5 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 430 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.42 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.42 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  64.88 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  66.28 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.34 
 
 		 426 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  66.05 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.1 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  63.64 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  66.05 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  65.89 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.04 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  64.65 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  65.65 
 
 		 427 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  65.41 
 
 		 425 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 		 428 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.87 
 
 		 427 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.68 
 
 		 433 aa  547  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 		 429 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  62.79 
 
 		 437 aa  544  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 		 425 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>