More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1794 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 
424 aa  665    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  88.21 
 
 
424 aa  753    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  75.94 
 
 
429 aa  643    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  81.56 
 
 
425 aa  688    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  75.71 
 
 
429 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  90.54 
 
 
424 aa  762    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
424 aa  862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  75.94 
 
 
427 aa  640    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  75.71 
 
 
426 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  75.94 
 
 
429 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  75.24 
 
 
427 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  77.83 
 
 
425 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  81.8 
 
 
425 aa  690    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  78.54 
 
 
429 aa  658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 
427 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 
430 aa  659    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  74.16 
 
 
423 aa  642    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  77.36 
 
 
427 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 
427 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  74.82 
 
 
425 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  81.8 
 
 
425 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  81.84 
 
 
424 aa  701    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  75.94 
 
 
427 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  77.83 
 
 
425 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  76.26 
 
 
427 aa  640    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  75.06 
 
 
426 aa  634    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  98.35 
 
 
424 aa  852    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  74.06 
 
 
425 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  74.06 
 
 
425 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  73.88 
 
 
425 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 
426 aa  633  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  74.53 
 
 
427 aa  628  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  74.59 
 
 
425 aa  627  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  76.85 
 
 
427 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  73.88 
 
 
425 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  75.06 
 
 
425 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  75.53 
 
 
428 aa  612  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  71.06 
 
 
425 aa  610  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 
424 aa  610  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  74.88 
 
 
424 aa  609  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  72.14 
 
 
437 aa  603  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  68.96 
 
 
428 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.1 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  70.78 
 
 
426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 
427 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  68.17 
 
 
427 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 
430 aa  568  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
429 aa  568  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  67.14 
 
 
427 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  67.93 
 
 
427 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.75 
 
 
429 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  64.83 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  64.83 
 
 
431 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
428 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
430 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
429 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 
428 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
427 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 
428 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
430 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
427 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
429 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 
422 aa  554  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  555  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  68.32 
 
 
430 aa  554  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
428 aa  555  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
426 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.46 
 
 
426 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
429 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  65.96 
 
 
431 aa  554  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
427 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.64 
 
 
424 aa  552  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
427 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
431 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
427 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
427 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  66.75 
 
 
428 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
428 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 
427 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 
430 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  65.24 
 
 
423 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
429 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
429 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>