More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3143 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 424 aa  853    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 		 425 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  76.12 
 
 		 424 aa  650    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 		 424 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  74.35 
 
 		 425 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  74.76 
 
 		 429 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 		 425 aa  650    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  78.54 
 
 		 424 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  76.18 
 
 		 424 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 		 425 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 		 427 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  74.59 
 
 		 425 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  74.06 
 
 		 427 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 430 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  74.76 
 
 		 425 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 		 427 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  75.76 
 
 		 425 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 		 424 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  74.94 
 
 		 425 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  75.78 
 
 		 427 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  74.94 
 
 		 425 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  74.53 
 
 		 429 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  74.94 
 
 		 425 aa  633  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  75.29 
 
 		 425 aa  634  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  73.58 
 
 		 426 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 		 427 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  73.58 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  74.06 
 
 		 429 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  72.17 
 
 		 424 aa  621  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  72 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  71.93 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  72.47 
 
 		 426 aa  619  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  70.1 
 
 		 423 aa  611  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  70.59 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  72.17 
 
 		 427 aa  607  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  69.58 
 
 		 426 aa  607  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  70.99 
 
 		 427 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  73.29 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 		 427 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  72.1 
 
 		 424 aa  596  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  71.33 
 
 		 437 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  67.85 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.86 
 
 		 426 aa  564  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  66.35 
 
 		 429 aa  566  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 427 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  66.43 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 		 429 aa  558  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 429 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 		 428 aa  551  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 		 429 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  62.41 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  63.7 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 		 430 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.9 
 
 		 422 aa  545  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  63.9 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 		 429 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>