More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0515 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  79.86 
 
 		 429 aa  690    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  79.34 
 
 		 425 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  82.35 
 
 		 425 aa  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 		 426 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  81.88 
 
 		 425 aa  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  77.75 
 
 		 427 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  78.87 
 
 		 425 aa  663    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 429 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  85.25 
 
 		 427 aa  734    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  79.34 
 
 		 425 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  77.23 
 
 		 427 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  76.06 
 
 		 430 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  77.23 
 
 		 427 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  76.11 
 
 		 427 aa  673    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  79.16 
 
 		 429 aa  683    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  76.98 
 
 		 427 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  77.36 
 
 		 424 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  78.17 
 
 		 427 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 427 aa  866    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  79.86 
 
 		 429 aa  689    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  74.65 
 
 		 427 aa  633  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  76.53 
 
 		 428 aa  631  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  76.85 
 
 		 424 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  75.24 
 
 		 424 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  77.09 
 
 		 424 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 		 426 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  75.71 
 
 		 424 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  73.82 
 
 		 426 aa  621  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  73.11 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 		 425 aa  619  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  74.59 
 
 		 424 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  71.7 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  70.99 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  70.99 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 		 424 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  69.93 
 
 		 423 aa  608  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  70.75 
 
 		 425 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  71.87 
 
 		 437 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  71.7 
 
 		 424 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  72.41 
 
 		 425 aa  591  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  69.21 
 
 		 428 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  69.81 
 
 		 425 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  69.98 
 
 		 426 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 431 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  67.06 
 
 		 429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  66.43 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 430 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 430 aa  564  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.34 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 		 434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 		 434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 		 426 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  65.81 
 
 		 432 aa  555  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 		 434 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.7 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  65.64 
 
 		 423 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  66.36 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  64.87 
 
 		 428 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.66 
 
 		 433 aa  554  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 428 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.26 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 		 429 aa  548  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.49 
 
 		 428 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  64.08 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  64.08 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 		 432 aa  548  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  62.73 
 
 		 434 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  64.08 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.61 
 
 		 429 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>