More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5019 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 428 aa  857    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 426 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  70.28 
 
 		 426 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  67.85 
 
 		 425 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 429 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  63.92 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 424 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  64.37 
 
 		 424 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  65.4 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 427 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1176  enolase  65.7 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0192586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 424 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 424 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  64.59 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  61.72 
 
 		 423 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  64.15 
 
 		 428 aa  539  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  63.98 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  61.06 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  64.11 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3356  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00269891  normal  0.865177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 424 aa  528  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  61 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  61.61 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  62.17 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  59.24 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  58.43 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  60.95 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  60.77 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  61.83 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  60.29 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  60.29 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  60.9 
 
 		 426 aa  511  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  59.91 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  59.72 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  61.34 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  58.67 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  59.52 
 
 		 430 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  61 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  59.23 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 427 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  58.67 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  59.38 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 428 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0593  phosphopyruvate hydratase  57.52 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  59.38 
 
 		 428 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  57.92 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  58.19 
 
 		 429 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  60.53 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  61.14 
 
 		 426 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  57.92 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  57.82 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 428 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  58.77 
 
 		 428 aa  504  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  57.11 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  58.87 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  61.14 
 
 		 426 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  59.38 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  58.53 
 
 		 427 aa  504  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  59.2 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  59.34 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  59.57 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0568  phosphopyruvate hydratase  57.52 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.183822  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  59.81 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>