More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1176 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1176  enolase  100 
 
 		 425 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0192586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3356  phosphopyruvate hydratase  67.39 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00269891  normal  0.865177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  65.7 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  64.2 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  62.05 
 
 		 424 aa  537  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  60.38 
 
 		 423 aa  533  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  63.21 
 
 		 425 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 		 424 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  61.1 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  60.94 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 		 425 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  61.08 
 
 		 424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  61.1 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  61.1 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  61.34 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  60.14 
 
 		 427 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 		 424 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  60.14 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  60.38 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  61.19 
 
 		 424 aa  511  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  61.58 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  60.38 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  60.38 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  58.47 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  58 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  60.33 
 
 		 429 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  59.43 
 
 		 424 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  58.47 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  62.05 
 
 		 437 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  59.9 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  59.21 
 
 		 424 aa  502  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  58.95 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  57.52 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  59.14 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  59.67 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  58.47 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  58.33 
 
 		 428 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  58.71 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  58.47 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  58.43 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  56.67 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  57.28 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  58.71 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  57.76 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  58.95 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  60.05 
 
 		 434 aa  494  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  58.19 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  60.14 
 
 		 422 aa  494  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  56.32 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  56.32 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  58.57 
 
 		 428 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  56.8 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  57.14 
 
 		 423 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  57.96 
 
 		 429 aa  494  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  57.86 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  58.33 
 
 		 428 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  58.57 
 
 		 428 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  60.38 
 
 		 425 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  56.09 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  58.67 
 
 		 430 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  60.49 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  60 
 
 		 430 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  58.57 
 
 		 429 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>