More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1042 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1042  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
428 aa  861    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 
430 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.17 
 
 
428 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
429 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 
430 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.82 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.95 
 
 
433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  64.32 
 
 
431 aa  560  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 
430 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 
427 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
429 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  65.41 
 
 
424 aa  556  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  65 
 
 
429 aa  553  1e-156  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 
428 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
431 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  63.55 
 
 
428 aa  551  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
429 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 
427 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 
428 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
429 aa  550  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  64.32 
 
 
427 aa  548  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
427 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
429 aa  549  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 
424 aa  548  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
429 aa  548  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  64.54 
 
 
422 aa  549  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
429 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 
429 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  62.15 
 
 
428 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 
427 aa  544  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  62.09 
 
 
427 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  60.89 
 
 
427 aa  547  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 
427 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  64.3 
 
 
426 aa  544  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 
427 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 
427 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.92 
 
 
422 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
426 aa  545  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  63.17 
 
 
430 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 
427 aa  541  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  62.94 
 
 
429 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  60.51 
 
 
433 aa  542  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
425 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  61.27 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
431 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
427 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  61.83 
 
 
427 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 
431 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 
431 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.91 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  63.1 
 
 
426 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  61.54 
 
 
429 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  61.77 
 
 
434 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  60.84 
 
 
429 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  61.79 
 
 
425 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  63.47 
 
 
428 aa  531  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  60.86 
 
 
432 aa  531  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  63.36 
 
 
432 aa  533  1e-150  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  61.12 
 
 
427 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  62.3 
 
 
427 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4532  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
429 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  61.79 
 
 
425 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
425 aa  532  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  61.36 
 
 
428 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 
425 aa  531  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
434 aa  532  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.17 
 
 
432 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  61.67 
 
 
426 aa  531  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  61.67 
 
 
423 aa  529  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  60.85 
 
 
425 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  60.61 
 
 
424 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  63.36 
 
 
430 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  61.18 
 
 
426 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  60.47 
 
 
426 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.38 
 
 
431 aa  528  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  59.58 
 
 
428 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 
427 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  64.3 
 
 
426 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  60.8 
 
 
427 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  61.08 
 
 
425 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  62.06 
 
 
428 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 
427 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  60.67 
 
 
427 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 
427 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  60.89 
 
 
427 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  59.77 
 
 
427 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  60.61 
 
 
425 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 
427 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  61.1 
 
 
434 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 
431 aa  525  1e-148  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  61.41 
 
 
426 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 
427 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  60.66 
 
 
427 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  62.89 
 
 
431 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 
428 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>