More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4373 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5032  enolase  82.86 
 
 
426 aa  722    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  100 
 
 
423 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  77.96 
 
 
427 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  69.65 
 
 
427 aa  622  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  71.19 
 
 
430 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  71.6 
 
 
431 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  70.14 
 
 
430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  67.74 
 
 
437 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  71.53 
 
 
430 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  69.27 
 
 
427 aa  598  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1972  phosphopyruvate hydratase  67.36 
 
 
437 aa  594  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0278  phosphopyruvate hydratase  67.05 
 
 
437 aa  592  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
430 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
437 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
430 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  67.22 
 
 
429 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0186  phosphopyruvate hydratase  65.97 
 
 
437 aa  584  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  67.38 
 
 
428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  66.27 
 
 
431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0223  phosphopyruvate hydratase  65.82 
 
 
437 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 
422 aa  581  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  66.83 
 
 
433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 
428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.63 
 
 
426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
431 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
431 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
431 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.39 
 
 
431 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
431 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
431 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.4 
 
 
428 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  65.18 
 
 
431 aa  568  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
425 aa  564  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  66.43 
 
 
426 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
427 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 
433 aa  566  1e-160  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  65.47 
 
 
431 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  65.47 
 
 
431 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
425 aa  564  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  65.95 
 
 
431 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  64.13 
 
 
424 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.15 
 
 
429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
428 aa  559  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  64.52 
 
 
422 aa  560  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
434 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65 
 
 
430 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 
425 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  62.06 
 
 
434 aa  555  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 
426 aa  557  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
431 aa  557  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 
434 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2603  enolase  67.14 
 
 
425 aa  557  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
431 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  60.95 
 
 
428 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
429 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  65.64 
 
 
427 aa  555  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 
427 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 
434 aa  556  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  61.85 
 
 
425 aa  555  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
431 aa  556  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
427 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  64.62 
 
 
431 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
429 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
427 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 
429 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 
429 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
424 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  62.44 
 
 
435 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0309  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
437 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000038709  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
424 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  60.48 
 
 
425 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 
425 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 
427 aa  548  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
424 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
426 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
426 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  62.62 
 
 
431 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 
429 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  61.79 
 
 
432 aa  546  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 
425 aa  544  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  60.95 
 
 
427 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  63.33 
 
 
429 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  63.81 
 
 
427 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  62 
 
 
429 aa  544  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 
429 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 
429 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3739  phosphopyruvate hydratase  62.47 
 
 
431 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535822  normal  0.0352048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
424 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  60.48 
 
 
427 aa  541  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  61.9 
 
 
427 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 
429 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.29 
 
 
427 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  62.47 
 
 
426 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>