More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2650 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  78.74 
 
 
427 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  78.97 
 
 
427 aa  681    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  90.42 
 
 
428 aa  788    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
428 aa  872    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  681    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  85.98 
 
 
427 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  73.83 
 
 
427 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  75.7 
 
 
428 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  78.84 
 
 
429 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  75.12 
 
 
427 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  78.97 
 
 
427 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  78.74 
 
 
427 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  72.66 
 
 
427 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  79.21 
 
 
427 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  78.97 
 
 
427 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  85.51 
 
 
427 aa  749    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  74.3 
 
 
427 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  84.58 
 
 
427 aa  724    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  78.74 
 
 
427 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  77.67 
 
 
429 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  79.21 
 
 
427 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  79.21 
 
 
427 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  79.21 
 
 
427 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  85.22 
 
 
433 aa  748    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  85.75 
 
 
427 aa  747    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  79.21 
 
 
427 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  78.74 
 
 
427 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  79.21 
 
 
427 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  88.79 
 
 
428 aa  758    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  75.93 
 
 
428 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  90.65 
 
 
428 aa  791    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 
427 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  89.95 
 
 
428 aa  784    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  84.62 
 
 
428 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  74.53 
 
 
427 aa  625  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  68.38 
 
 
426 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.42 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  63.08 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.42 
 
 
431 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
431 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
429 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  64.25 
 
 
426 aa  568  1e-161  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
430 aa  568  1e-161  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
430 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
428 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  65.12 
 
 
429 aa  567  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  66.04 
 
 
427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 
434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
430 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  63.66 
 
 
434 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
431 aa  558  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0628  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
435 aa  559  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00147934  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
430 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  64.42 
 
 
431 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
431 aa  558  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  63.64 
 
 
430 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0668  phosphopyruvate hydratase  63.89 
 
 
433 aa  559  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000444589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  64.19 
 
 
431 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  62.7 
 
 
431 aa  554  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.53 
 
 
425 aa  555  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
428 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  63.55 
 
 
428 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1470  enolase  65.57 
 
 
425 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 
429 aa  552  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 
429 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  61.97 
 
 
425 aa  551  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.17 
 
 
432 aa  553  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 
426 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0852  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
426 aa  548  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  62.38 
 
 
429 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 
432 aa  549  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  64.4 
 
 
426 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  64.32 
 
 
434 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
431 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  62.97 
 
 
431 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  60.98 
 
 
428 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0684  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
434 aa  549  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 
430 aa  545  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 
427 aa  547  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
425 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  64.47 
 
 
426 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 
429 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
431 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
433 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 
431 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  63.81 
 
 
423 aa  543  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  63 
 
 
428 aa  541  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  62.12 
 
 
425 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 
427 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  63.4 
 
 
427 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>