More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5894 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  78.35 
 
 
424 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  80.19 
 
 
425 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 
424 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  78.59 
 
 
427 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  80.19 
 
 
425 aa  673    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  87.74 
 
 
429 aa  740    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  78.42 
 
 
427 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  76.47 
 
 
426 aa  666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  77.83 
 
 
424 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
425 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  82.59 
 
 
427 aa  705    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  87.74 
 
 
429 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  78.82 
 
 
427 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  78.12 
 
 
430 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  80.24 
 
 
427 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  76.94 
 
 
427 aa  670    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  88.44 
 
 
429 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 
425 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  82.35 
 
 
427 aa  693    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  80.19 
 
 
425 aa  673    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  77.59 
 
 
424 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  96.47 
 
 
425 aa  810    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  77.65 
 
 
427 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  77.83 
 
 
424 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  87.74 
 
 
429 aa  741    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  78.3 
 
 
424 aa  651    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  73.75 
 
 
423 aa  642    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  77.33 
 
 
424 aa  633  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  75.94 
 
 
424 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  77.3 
 
 
428 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  75 
 
 
426 aa  629  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  75.06 
 
 
427 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 
425 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 
425 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  73.35 
 
 
425 aa  625  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  73.58 
 
 
425 aa  624  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 
425 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  72.41 
 
 
426 aa  617  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  74.47 
 
 
437 aa  620  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  75.71 
 
 
425 aa  619  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  71.93 
 
 
425 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2739  enolase  70.45 
 
 
426 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0835807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  67.69 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  66.9 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
428 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  67.68 
 
 
430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  67.22 
 
 
429 aa  568  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  67.92 
 
 
429 aa  564  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.56 
 
 
429 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  66.98 
 
 
426 aa  565  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  68.18 
 
 
428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 
427 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  64.76 
 
 
427 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
431 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  66.43 
 
 
427 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 
430 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 
430 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 
429 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
428 aa  558  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 
429 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
429 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
427 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  65.72 
 
 
427 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
428 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  67.21 
 
 
429 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 
433 aa  554  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.03 
 
 
429 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  63.42 
 
 
432 aa  556  1e-157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.46 
 
 
429 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
428 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.33 
 
 
428 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  66.59 
 
 
426 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
429 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 
428 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.49 
 
 
431 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  66.43 
 
 
426 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.01 
 
 
427 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
427 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  63.92 
 
 
424 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
427 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 
429 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
426 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 
425 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  67.61 
 
 
425 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
426 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
428 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
425 aa  547  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  63.39 
 
 
437 aa  545  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 
429 aa  544  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  65.63 
 
 
427 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  64.79 
 
 
427 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  64.54 
 
 
427 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  62.68 
 
 
431 aa  546  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  64.17 
 
 
432 aa  547  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  65.57 
 
 
428 aa  544  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 
430 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 
427 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>