More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1570 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  76.29 
 
 
429 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  76.64 
 
 
428 aa  649    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  76.29 
 
 
429 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  100 
 
 
427 aa  859    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  76.29 
 
 
429 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  78.12 
 
 
429 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  77.8 
 
 
429 aa  649    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  75.76 
 
 
429 aa  619  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4431  enolase  74.3 
 
 
431 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.117661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  72.47 
 
 
428 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  72.71 
 
 
428 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  70.52 
 
 
425 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  72.04 
 
 
427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  71.29 
 
 
428 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  70.28 
 
 
427 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  71.23 
 
 
425 aa  596  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  71.93 
 
 
426 aa  597  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  72.58 
 
 
429 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  71.23 
 
 
427 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  68.87 
 
 
426 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  70.21 
 
 
431 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  69.58 
 
 
427 aa  584  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  71.56 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  68.4 
 
 
426 aa  581  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  69.34 
 
 
427 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  67.53 
 
 
426 aa  579  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  67.92 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  68.4 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  70.33 
 
 
430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  69.34 
 
 
426 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  68.63 
 
 
426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  67.45 
 
 
429 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  68.47 
 
 
427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  67.52 
 
 
428 aa  560  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
428 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  66.43 
 
 
430 aa  548  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
425 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 
422 aa  544  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
427 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.39 
 
 
428 aa  538  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
425 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  63.68 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  65.55 
 
 
437 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
425 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 
428 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
428 aa  535  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  65.8 
 
 
425 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 
425 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
427 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  64.83 
 
 
426 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  65.62 
 
 
427 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  63.31 
 
 
424 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 
425 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
430 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
425 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  64.93 
 
 
427 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
431 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
431 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  61.97 
 
 
431 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  63.47 
 
 
429 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
431 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  63.7 
 
 
429 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
431 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.51 
 
 
427 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
431 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  63.25 
 
 
425 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  62.12 
 
 
430 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  63.33 
 
 
433 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1632  phosphopyruvate hydratase  64.99 
 
 
424 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  65.47 
 
 
424 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  63.76 
 
 
429 aa  521  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  61.01 
 
 
437 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
425 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
425 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 
429 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
424 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  60.24 
 
 
425 aa  523  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  64.3 
 
 
427 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  63.23 
 
 
429 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  61.34 
 
 
423 aa  524  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
429 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 
429 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  60.38 
 
 
424 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 
429 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  63.36 
 
 
428 aa  519  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
429 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  518  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 
426 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  57.88 
 
 
432 aa  521  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  62.21 
 
 
431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 
431 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  62.8 
 
 
426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 
427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  61.88 
 
 
431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  60.28 
 
 
427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 
431 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  59.39 
 
 
430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  60.47 
 
 
430 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>