More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0920 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  78.22 
 
 
427 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  77 
 
 
426 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  77.36 
 
 
426 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  76.89 
 
 
429 aa  663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  78.72 
 
 
427 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  77.99 
 
 
427 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  78.64 
 
 
430 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  78.77 
 
 
428 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  79.01 
 
 
428 aa  653    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  80.57 
 
 
427 aa  658    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  78.54 
 
 
428 aa  643    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  76.89 
 
 
429 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  77.65 
 
 
429 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  76.12 
 
 
425 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  100 
 
 
429 aa  858    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  78.12 
 
 
427 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  78.44 
 
 
425 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  76.89 
 
 
429 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  78.07 
 
 
429 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  79.86 
 
 
427 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  75.94 
 
 
426 aa  630  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  76 
 
 
426 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  72.58 
 
 
427 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  75 
 
 
428 aa  626  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  71.83 
 
 
426 aa  621  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  74.83 
 
 
429 aa  622  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  74.7 
 
 
431 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  75.23 
 
 
428 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  73.82 
 
 
426 aa  618  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4431  enolase  75.59 
 
 
431 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.117661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  74.06 
 
 
426 aa  617  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  73.76 
 
 
427 aa  617  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  76.65 
 
 
429 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 
425 aa  596  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  71.19 
 
 
430 aa  591  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  72.47 
 
 
427 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
428 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.86 
 
 
429 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
425 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
425 aa  551  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 
425 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.15 
 
 
427 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.72 
 
 
426 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  64.78 
 
 
428 aa  547  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 
425 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  64.59 
 
 
427 aa  532  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 
429 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.08 
 
 
425 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  63.62 
 
 
428 aa  534  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  64.93 
 
 
437 aa  533  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  61.21 
 
 
430 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02271  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 
432 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
428 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 
428 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  60.51 
 
 
430 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 
431 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 
425 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  61.59 
 
 
428 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 
424 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 
422 aa  525  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 
424 aa  525  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  61.93 
 
 
423 aa  526  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
429 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  60.19 
 
 
429 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  60.57 
 
 
430 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  63.32 
 
 
429 aa  524  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0451  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 
432 aa  521  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  65.54 
 
 
424 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  60.85 
 
 
424 aa  521  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
429 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  63.33 
 
 
427 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  62.86 
 
 
430 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.57 
 
 
427 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  65.96 
 
 
426 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
429 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 
429 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
424 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 
425 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  61.27 
 
 
430 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
429 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 
434 aa  520  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 
425 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
426 aa  518  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  62.53 
 
 
427 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  59.9 
 
 
430 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  59.23 
 
 
429 aa  518  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10480  enolase  64.47 
 
 
429 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  62.26 
 
 
429 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  59.9 
 
 
430 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 
425 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  63.27 
 
 
425 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  59.9 
 
 
430 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  61.19 
 
 
423 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02371  phosphopyruvate hydratase  60.29 
 
 
430 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  59.35 
 
 
430 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  64.01 
 
 
427 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  60.05 
 
 
429 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  63.62 
 
 
429 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1631  enolase  62.05 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>