More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1073 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
431 aa  866    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  77.65 
 
 
427 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  76.36 
 
 
428 aa  643    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  73.71 
 
 
429 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  73.71 
 
 
429 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  73.71 
 
 
429 aa  631  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  76.36 
 
 
427 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  72.54 
 
 
426 aa  627  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  76.42 
 
 
429 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  76.6 
 
 
428 aa  626  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  75.65 
 
 
427 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  74.47 
 
 
426 aa  621  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  75.41 
 
 
428 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  72.81 
 
 
426 aa  618  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  75.35 
 
 
428 aa  618  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  75.71 
 
 
429 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  72.54 
 
 
426 aa  615  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  74.17 
 
 
427 aa  615  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  74.23 
 
 
426 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  72.54 
 
 
426 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  72.54 
 
 
425 aa  614  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  75.93 
 
 
430 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  74.06 
 
 
428 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  74.35 
 
 
427 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  73.76 
 
 
425 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  73.05 
 
 
427 aa  608  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  71.16 
 
 
426 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  73.76 
 
 
427 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  73.47 
 
 
429 aa  610  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  72.3 
 
 
425 aa  605  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  74.7 
 
 
429 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  70.21 
 
 
427 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  71.19 
 
 
427 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4431  enolase  72.13 
 
 
431 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.117661  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  72.03 
 
 
429 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  68.14 
 
 
430 aa  565  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 
428 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.24 
 
 
425 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  63.44 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  62.35 
 
 
425 aa  535  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
427 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  59.71 
 
 
429 aa  533  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  61.41 
 
 
430 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  65.08 
 
 
428 aa  532  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  63.29 
 
 
429 aa  530  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  63.36 
 
 
428 aa  529  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 
425 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.47 
 
 
426 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 
425 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 
424 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  61.37 
 
 
428 aa  527  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  61.45 
 
 
428 aa  525  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.02 
 
 
429 aa  521  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0775  phosphopyruvate hydratase  59.95 
 
 
432 aa  521  1e-147  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  61.18 
 
 
430 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3486  Phosphopyruvate hydratase  62.8 
 
 
426 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194771  normal  0.960022 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0662  phosphopyruvate hydratase  61.94 
 
 
431 aa  521  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1687  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 
430 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1705  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 
430 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  63.79 
 
 
429 aa  520  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
429 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  62.74 
 
 
426 aa  520  1e-146  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 
425 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  60.61 
 
 
429 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62.29 
 
 
425 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
429 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  63.83 
 
 
426 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 
426 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 
429 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4022  phosphopyruvate hydratase  62.47 
 
 
430 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 
433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  62.95 
 
 
422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  59.19 
 
 
431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 
429 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  63.55 
 
 
429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 
429 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  61.93 
 
 
430 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  63.06 
 
 
428 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  59.76 
 
 
430 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  58.51 
 
 
429 aa  511  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
427 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  61.32 
 
 
427 aa  513  1e-144  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 
425 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 
434 aa  508  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  61.18 
 
 
427 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  59.48 
 
 
431 aa  508  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  61.47 
 
 
427 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  63.07 
 
 
427 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0515  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
427 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  58.51 
 
 
429 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
427 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  63.59 
 
 
427 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  64.2 
 
 
437 aa  510  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  57.88 
 
 
432 aa  510  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  61.47 
 
 
427 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  59.53 
 
 
429 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1631  enolase  62.56 
 
 
429 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>