More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0671 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  78.74 
 
 		 428 aa  657    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  78.3 
 
 		 426 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  100 
 
 		 428 aa  854    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  77.57 
 
 		 427 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  86.65 
 
 		 428 aa  735    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4431  enolase  77.41 
 
 		 431 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.117661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  79.44 
 
 		 429 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  78.04 
 
 		 429 aa  678    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  78.04 
 
 		 429 aa  678    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  76 
 
 		 426 aa  651    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  76.65 
 
 		 426 aa  639    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  78.04 
 
 		 429 aa  678    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  81.07 
 
 		 429 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  76.4 
 
 		 427 aa  634  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  78.74 
 
 		 429 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  74.76 
 
 		 426 aa  632  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  78.77 
 
 		 429 aa  631  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  75.29 
 
 		 428 aa  628  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  74.76 
 
 		 426 aa  630  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  74.53 
 
 		 426 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  73.82 
 
 		 427 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  75.93 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  78.01 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  72.47 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  73.82 
 
 		 427 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  75.24 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  76.33 
 
 		 430 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  75.24 
 
 		 426 aa  621  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8581  Phosphopyruvate hydratase  75.47 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.20532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  75.41 
 
 		 431 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  72.17 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  73.58 
 
 		 425 aa  610  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2682  enolase  73.65 
 
 		 427 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  72.88 
 
 		 425 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  71.73 
 
 		 430 aa  600  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1909  enolase  72.64 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  65.09 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.94 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  63.12 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2223  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  64.52 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 		 433 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  63.29 
 
 		 425 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.07 
 
 		 426 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 430 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  65.25 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  65.71 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  61.79 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  60.99 
 
 		 431 aa  532  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  61.08 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  62.5 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  61.88 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  61.23 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  61.19 
 
 		 431 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  61.19 
 
 		 431 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  62.8 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  62.82 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  65.32 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  64 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  64.22 
 
 		 425 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  62.88 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  62.62 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  60.24 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  63.74 
 
 		 425 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0523  phosphopyruvate hydratase  63.83 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  58.22 
 
 		 431 aa  519  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  63.76 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  61.88 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  62.68 
 
 		 429 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  59.48 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0775  phosphopyruvate hydratase  60.76 
 
 		 432 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  60.43 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 		 424 aa  521  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  62.03 
 
 		 429 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1184  Phosphopyruvate hydratase  62.32 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  64.3 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  62.44 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3486  Phosphopyruvate hydratase  61.59 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194771  normal  0.960022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  60.86 
 
 		 430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  60.76 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  62.56 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  62.82 
 
 		 429 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  61.74 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1101  phosphopyruvate hydratase  59.86 
 
 		 426 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.476094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  64.35 
 
 		 424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1413  enolase  63.59 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  hitchhiker  0.00000160443 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  58.12 
 
 		 432 aa  518  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>